Cortex Command — это необычный инди-экшен с элементами стратегии и песочницы, который предлагает игроку управлять базой и вести боевые операции на процедурно генерируемых картах. Главная задача — добыча ресурсов и уничтожение вражеского командного центра, используя разнообразные юниты и технику.
Геймплей строится на сочетании управления отрядом и прямого контроля персонажей. Игрок может переключаться между бойцами, отдавать приказы или лично участвовать в сражениях. Особую роль играет физика: разрушение окружения и поведение объектов добавляют хаоса и делают каждую битву уникальной.
В игре представлен широкий выбор оружия, техники и способов ведения боя. Можно действовать аккуратно, прокладывая тоннели, или идти напролом, используя тяжелое вооружение. Экономическая система также важна — необходимо грамотно распределять ресурсы для поддержания армии.
Cortex Command привлекает своей свободой действий, нестандартным подходом к жанру и высокой реиграбельностью, предлагая каждый раз новые сценарии и тактики.